Après une formation à l'École nationale supérieure des Arts appliqués et des Métiers d'arts Olivier de Serres et au Conservatoire national supérieur d'Art dramatique, Éric Ruf entre à la Comédie-Française le 1er septembre 1993, en devient le 498e sociétaire le 1er janvier 1998, puis sociétaire honoraire le 24 décembre 2014. Il est administrateur général de la Comédie-Française depuis août 2014. Il y mène une politique artistique où se côtoient grands maîtres de la mise en scène et talents émergents et un travail de fond pour la diversité et la parité sur les scènes de l’institution.

Au théâtre, il a travaillé notamment sous la direction de Jacques Lassalle, Patrice Chéreau, Alain Françon, Denis Podalydès, Christian Schiaretti, Anatoli Vassiliev, Yves Beaunesne, Jean-Yves Ruf, Éric Vignier, Jean-Pierre Vincent, Jean-Luc Boutté, Jean Dautremay, Jérôme Savary....
Il a interprété Christian dans Cyrano de Bergerac de Rostand mis en scène par Denis Podalydès, Brel dans Trois hommes dans un salon mis en scène par Anne Kessler, Achille dans Penthésilée de Kleist mise en scène par Jean Liermier. Il a été le collaborateur artistique d’Émilie Valantin et réalisé le décor de Vie du grand dom Quichotte et du gros Sancho Pança de da Silva mise en scène par Émilie Valantin.

Au cinéma et à la télévision, on a pu le voir dans des réalisations d’Yves Angelo, Nicole Garcia, Arnaud Desplechin, Nina Companeez, Josée Dayan, Valéria Bruni-Tedeschi, Emmanuel Bourdieu, Yvan Attal, Roman Polansky, Martin Bourboulon...

Directeur artistique de la compagnie d'Edvin(e), il a coécrit et mis en scène Du désavantage du vent (édition Les Solitaires Intempestifs) et Les belles endormies du bord de scène ainsi qu'Armen de Jean-Pierre Abraham.

Au Studio-Théâtre de la Comédie-Française, il a mis en scène Et ne va malheurer de ton malheur ma vie, spectacle conçu autour des tragédies de Robert Garnier.
À l'opéra, il a mis en scène et fait la scénographie du Récit de l'an Zéro de Maurice Ohana et de L'Histoire de l'an Un de Jean-Christophe Marti, dirigé La Bohème au Théâtre des Champs Elysées et Roméo et Juliette à l’Opéra-Comique et en tournée.
Il a dirigé et fait la scénographie d'un atelier sur Christoph Willibald Gluck avec l'Atelier lyrique de l'Opéra de Paris et a enseigné au Cours Florent et au Conservatoire national supérieur d'art dramatique.
Scénographe de ses propres spectacles, il créé régulièrement des décors pour les mises en scène de Denis Podalydès, Clément Herrvieu-Léger, Valérie Lesort et Christian Hecq, Julie Deliquet...

En 2020, il lance La Comédie continue ! webtélé de la Comédie-Française qui diffuse 7 jours/7 pendant les huit semaines du confinement. Face au succès public du dispositif, il poursuit le développement en créant le Théâtre à la table, nouvel objet audiovisuel de théâtre.

Prix Gérard-Philipe de la Ville de Paris (1999), il a reçu en 2007 les Molière du décorateur et du second rôle masculin pour Cyrano de Bergerac, en 2012 le Prix Beaumarchais du Figaro et le Grand Prix du syndicat de la Critique pour le meilleur spectacle théâtral de l'année pour Peer Gynt et en 2016 le Molière de la création visuelle pour 20 000 lieues sous les mers d’après Jules Verne. En tant qu’administrateur général, il a reçu le Molière du Théâtre public à trois reprises, pour Les Damnés en 2017, La Nuit des rois ou Tout ce que vous voulez en 2019 et Le Bourgeois gentilhomme en 2023.

Éric Ruf est commandeur dans l’ordre des Arts et Lettres.